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     底質(zhì)預(yù)處理主要是根據(jù)河湖底泥實際情況，對水體底泥進行消毒及淤泥活化等處理措施，其目的是殺滅原來污染水體底質(zhì)中病原微生物及其他有害生物；同時，可向水體中投放適量石灰乳，以改善底質(zhì)酸堿度；此外，通過本土微生物的分離、培養(yǎng)、馴化，調(diào)配多種有益微生物菌種，擴大培養(yǎng)后投放水體，以活化底質(zhì)，同時降低水體COD、BOD濃度。
    此外，對于硬質(zhì)駁岸濱岸區(qū)底質(zhì)，恢復(fù)底質(zhì)底泥厚度，培育恢復(fù)本土微生物，近岸水體投放光合細菌、有益放線菌和有益芽胞桿菌等建立混合微生物群體，促進水體含碳有機物、含磷和硫物質(zhì)的分解，投放氨氧化細菌與反硝化細菌，用于對水體中氨氮、尿素、尿酸、氨基酸、蛋白質(zhì)等含氮物質(zhì)的 分解，建立并恢復(fù)水生動植物的生長環(huán)境。通過以上措施實施，消除或者減緩其對后期生態(tài)防御系統(tǒng)的負面影響，建立或者恢復(fù)底質(zhì)有益微生物處理系統(tǒng)，促進沉水植物群落的生長及系統(tǒng)的恢復(fù)和穩(wěn)定，提高水體水質(zhì)凈化效果。